São conhecidas mais de 80 doenças autoimunes, sendo as mais comuns:

• Anemia perniciosa;

• Artrite Reumatóide;

• Artrite psoriática;

• Cirrose biliar primária;

• Colangite esclerosante;

• Dermatomiosite / Polimiosite;

• Diabetes juvenil (diabetes do tipo 1);

• Doença celíaca;

• Doença de Crohn;

• Esclerodermia;

• Esclerose múltipla;

• Esclerose sistémica;

• Glomerulonefrite;

• Hepatite autoimune;

•  Lúpus;

• Miastenia gravis;

• Pênfigo;

• Púrpura trombocitopénica idiopática;

• Psoríase;

• Síndrome antifosfolípidico;

• Síndrome de Sjogren;

• Tireoidites (Graves, Hashimoto);

•  Uveíte;

• Vasculites;

• Vitiligo.